Skip to content

Diagnoza kliniczna za pomocą sekwencjonowania całego genomu próbki prenatalnej AD 7

4 dni ago

715 words

Oznaczenie punktu przerwania 8q13 przez kariotypowanie nie potwierdziło przewidywania zaburzenia w CHD7 przy 8q12.2 ani nie zapewniło wystarczającej rozdzielczości do rozważenia określonych genów w diagnostyce różnicowej (ryc. S4 w dodatku uzupełniającym). Rzeczywiście, gdyby pułapki w paśmie GTG zostały błędnie zinterpretowane przez widoczny prążek w każdym kierunku (co nie jest rzadkim zjawiskiem zgodnie z naszym sekwencjonowaniem takich zrównoważonych rearanżacji8,11), oznaczałoby to rozważenie, na samym chromosomie 8, około 38 Mb DNA zawierającego 288 potencjalnych genów przyczyniających się do powstawania genotypów, z których 39 było związanych z chorobą, zgodnie z bazą danych OMIM, a co najmniej 4 wiązało się z wadami serca. Ponadto, nasze poprzednie analizy pokazały, że rearanżacje, które wydają się być zrównoważone przy ustalaniu kariotypu, mogą być złożone przy rozdzielczości nukleotydów (przy skomplikowanych rearanżacjach odpowiadających około 20% wszystkich zdarzeń) .8 W przypadku, o którym tu mówimy, przegląd sekwencji oparty na kariotyp pozwolił na definitywny opis przyczynowego syndromu umiejscowienia. Takiej precyzji diagnostycznej i wynikającej z niej prognozy fenotypowej nie można obecnie uzyskać za pomocą innych metod, a wyniki uzyskano w ramach czasowych podobnych do tych wymaganych w konwencjonalnych metodach cytogenetycznych przed urodzeniem. Zespół CHARGE jest rzadką, zwykle sporadyczną chorobą, która może obejmować nieprawidłowości czaszkowo-nerwowe i przetokę tchawiczo-przełykową oprócz cech wymienionych w sekcji podsumowania.14,15 Poprzednie badania sugerują zmiany CHD7 u 90% pacjentów spełniających kryteria diagnostyczne dla zespół CHARGE.12 CHD7 jest wysoce konserwatywnym członkiem rodziny hematazy chromodomenowej; zmienia ekspresję genu przez remodeling chromatynę 16. Mutacje CHD7 mają zatem potencjalnie szeroko zakrojone efekty fenotypowe. Zakłócenie CHD7 stanowi silny czynnik ryzyka genetycznego dla zespołu CHARGE, chociaż nie wszystkie zaburzenia CHD7 są w pełni penetrantowe, ponieważ delecje dotykające część górnego lub kodującego regionu CHD7 zidentyfikowano u fenotypowo normalnych osób pochodzenia azjatyckiego i afrykańskiego. 17,18 Niemniej jednak, jeśli wykryta zostanie mutacja CHD7, zalecane są badania kliniczne i poradnictwo genetyczne.18
Punkt przerwania chromosomu 6 zniszczył LMBRD1, który koduje lizosomalne białko błonowe biorące udział w transporcie i metabolizmie kobalaminy. Mutacje Frameshift prowadzące do utraty funkcji LMBRD1 są związane z recesywnym zaburzeniem aciduria metylmalonowa i homocystynuria (typ kobalaminy F) (numer OMIM, 277380) .13 Przerwanie pojedynczej kopii locus jest mało prawdopodobne, aby spowodować zaburzenie, a nasze Po porodzie przemiana metaboliczna omawianego przypadku wykluczyła zespół metaboliczny.
Wykrywanie zaburzeń CHD7 i wynikająca z tego diagnoza zespołu CHARGE prawdopodobnie wpłynęłyby na poradnictwo genetyczne, późniejsze dyskusje dotyczące zarządzania ciążą oraz przygotowanie zespołu opieki zdrowotnej i rodziców na możliwość wystąpienia wielu zagrażających życiu stanów medycznych wymagających natychmiastowego leczenia trudności z oddychaniem i karmieniem po porodzie.19 Gdybyśmy nie wykryli jasno przewidywanego locus przyczynowego, ocenilibyśmy przegrupowanie ze względu na prawdopodobieństwo reprezentacji łagodnej zmiany lub jej oznaczenie jako wariant o nieznanym znaczeniu, stosując analizy diagnostyki klinicznej i populacji oparte na danych ilości kopii, wraz z dostępnymi odkryciami stałej zmienności genetycznej z badań sekwencjonowania egzomu, zasobami takimi jak projekt 1000 genomów oraz badania asocjacji genomewidu w klinicznych kohortach i kontrolach Chociaż zalety, ograniczenia i interpretacja takich dodatkowych zbiorów danych wymagają starannej dyskusji i odpowiedniej ostrożności w związku z naszym wciąż ograniczonym zrozumieniem konsekwencji funkcjonalnych zakłócenia określonych sekwencji w ludzkim genomie, ważne jest, aby wziąć pod uwagę, że decyzje medyczne są zwykle na podstawie obecności przegrupowania chromosomu, bez dodatkowych informacji prognostycznych. W najlepszym przypadku przeprowadza się test CGH z wykorzystaniem macierzy wtórnej, który u tego pacjenta i większości osób z pozornie zrównoważonymi nieprawidłowościami daje normalny wynik. Nasze badanie pokazuje zatem siłę predykcyjną pangenomicznego parowania z końcem końca i wskazuje na złożoność interpretacji, która może doprowadzić do konfrontacji z diagnostyką ultra-wysokiej rozdzielczości.
Chociaż kwestie naukowe, medyczne i etyczne powinny być uważnie ocenione, strategia ta, gdy jest stosowana w warunkach prenatalnych, może wykrywać zmiany genetyczne, które mogą zmienić przebieg i przebieg położniczy, zapewniając podstawę dla decyzji dotyczących zakończenia leczenia, terapii płodowej, sposobu porodu oraz skierowanie do placówki opieki trzeciego stopnia z zaawansowaną wiedzą w zakresie zarządzania.
[przypisy: lekarz dermatologendokrynolog Wrocław, endometrioza leczenie hormonalne, Usługi stomatologiczne ]
[więcej w: pekom żary, enea gryfice, urokinaza ]

0 thoughts on “Diagnoza kliniczna za pomocą sekwencjonowania całego genomu próbki prenatalnej AD 7”