Skip to content

NALP1 w wielu chorobach autoimmunologicznych związanych z czerwienicą ad 7

1 miesiąc ago

186 words

Ogólnie obserwowaliśmy silniejsze powiązanie dla rozszerzonego fenotypu choroby autoimmunologicznej i auto-zapalnej niż dla mniejszej podgrupy bielactwa (Tabela 4 w Dodatku Uzupełniającym). Tabela 2. Tabela 2. Powiązanie 19 wariantów NALP1 z bielactwem i chorobą autoimmunologiczną i autoinapalną w 114 rodzinach multipleksowych. Pozorne powiązania choroby z wieloma markerami w regionie NALP1 mogą odzwierciedlać wiele niezależnych wariantów przyczynowych lub mogą być konsekwencją nierównowagi sprzężeń między wieloma markerami i jednym prawdziwym wariantem przyczynowym. Dopasowanie pozycji genomowych (figura 1C) i wzoru sprzężenia-nierównowagi (figura 1D i tabela 2) 19 markerów regionu NALP1 (17 SNP i 2 polimorfizmy insercyjno-delecyjne), dla których związek z chorobą został powtórzony w dwóch seria (za pomocą testu nierównowagi rodowodowej i testu powiązania rodzinnego) sugerowała, że co najmniej dwa markery mogą być niezależnie związane z chorobą. Aby odróżnić markery, które mogą odzwierciedlać warianty niezależne od tych, które jedynie odzwierciedlają nierównowagę sprzężeń, przeprowadziliśmy warunkowe analizy regresji logistycznej21 tych 19 markerów (tabela 2 i tabela 5 w dodatkowym dodatku). Na podstawie tej analizy, trzy markery (rs6502867, rs8182352 i rs4790797) miały największe indywidualne efekty zarówno dla rozszerzonego fenotypu choroby autoimmunologicznej i autoimmunologicznej (iloraz szans, odpowiednio 1,93, 1,81 i 1,82, P <0,001 dla wszystkich trzech markery) i fenotypu bielactwa (iloraz szans, odpowiednio 2,08, 2,01 i 2,01, P <0,001 dla wszystkich trzech markerów). Włączenie rs6502867 znacznie poprawiło dopasowanie modeli logistyczno-regresyjnych, które obejmowały dowolne z 18 innych markerów; odwrotnie, dopasowanie modelu, w tym rs6502867, znacznie poprawiło się dzięki włączeniu dowolnego z 15 z 18 innych markerów (Tabela 5 w Dodatku uzupełniającym). Wyniki te dostarczają dalszego wsparcia dla istnienia co najmniej dwóch niezależnych wariantów w regionie NALP1 związanych z ryzykiem choroby: jeden wariant oznaczony przez rs6502867, a drugi zlokalizowany dalej w górę, w bliższym regionie kodującym lub w promotorze transkrypcji.
Markery rs878329, rs7223628, rs8182352 i rs4790796 są w prawie doskonałej równowadze sprzężeń z rs4790797 (tabela 6 w dodatkowym dodatku), co wskazuje, że te pięć SNP, które obejmują tylko 2107 zasad, wszystkie reprezentują ten sam sygnał. Kolinearność pięciu markerów wyklucza analizy logistyczno-regresyjne, które obejmują dowolne dwa z nich. Włączenie rs4790797 znacząco poprawiło dopasowanie modeli, które zawierały z 14 pozostałych znaczników, z wyjątkiem rs12150220 i rs2670660, podczas gdy żaden z pozostałych 14 znaczników, z wyjątkiem rs6502867, nie poprawił dopasowania modelu, który obejmował rs4790797. Wyniki te sugerują, że asocjacja 11 z 14 markerów (rs961826, rs17,77575, rs1877658, rs925597, rs925598, rs3926687, delecja 12 bp, rs2733359, rs35658367, rs2716914 i rs8182354) z chorobą może być wtórna do nierównowagi sprzężenia z grupa 5 SNP reprezentowanych przez rs4790797. Ogólnie rzecz biorąc, markerem najsilniej związanym z chorobą był rs4790797, ale nie można było go odróżnić od rs12150220 i rs2670660 w analizie logistyczno-regresyjnej (tabela 5 w dodatkowym dodatku)
[przypisy: międzynarodowa statystyczna klasyfikacja chorób i problemów zdrowotnych, enea gryfice, acetaminofen ]

0 thoughts on “NALP1 w wielu chorobach autoimmunologicznych związanych z czerwienicą ad 7”